工作中有用到VEP,确实是一款出色的注释软件。相比ANNOVAR,最大的优点是支持HGVS标准的注释。 可能由于ANNOVAR面世比较早,当时很多变异描述的标准还没有通行,ANNOVAR采取的是按照基因组来 left-normalization 的方法,而HGVS的标准,则是根据基因/转录本的方向来 left-normalization ,因此有可能有的基因与ANNOVAR注释的方向相反。在某些地…
工作中有用到VEP,确实是一款出色的注释软件。相比ANNOVAR,最大的优点是支持HGVS标准的注释。 可能由于ANNOVAR面世比较早,当时很多变异描述的标准还没有通行,ANNOVAR采取的是按照基因组来 left-normalization 的方法,而HGVS的标准,则是根据基因/转录本的方向来 left-normalization ,因此有可能有的基因与ANNOVAR注释的方向相反。在某些地…
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