使用 Github Actions 自动更新 ANNOVAR 的 Clinvar 数据库

郑郑泽鑫的博客 zhengzexin.com 2021/06/15

前段时间，看到ANNOVAR在文档里更新了一个可以自行更新Clinvar数据库的脚本，ANNOVAR更新Clinvar的频率，一般是半年到一年才更新一次。 恰好又看到Github新推出了 “Flat Data” ，就想着是不是能够像Flat Data一样，抓取Clinvar数据库，然后定期更新成ANNOVAR数据库；可惜研究了一圈，Flat Data的示例都是使用JavaScript或者Types…